Kính hiển vi có một khoảng giá rất lớn, từ rẻ đến mức chấp nhận được (xem thêm Kính hiển vi quang học). Đặc biệt là loại dùng cho giáo dục, giá kính hiển vi có vai trò quan trọng, bạn có thể lựa chọn mức giá tốt nếu bỏ qua những cấu hình không cần thiết.
Các cấu hình dưới đây không cần thiết cho trường học. Bạn có thể dựa vào các cấu hình này để tiết kiệm tiền khi mua kính hiển vi dùng trong trường học.
Quang học vô cực: loại này mắc tiền và không phổ biến để sử dụng trong giáo dục. Quang học vô cực không thể thay thế được giữa các nhà sản xuất với nhau. Bạn sẽ gặp vấn đề nếu cần thay thế vật kính bởi vì vật kính đi theo nhà sản xuất. Thuận lợi của quang học vô cực là khi sử dụng kính lọc hoặc các công việc có liên quan tới chụp ảnh từ kính hiển vi. Vì vậy loại này thường được sử dụng trong các kính hiển vi cho nghiên cứu y sinh.
Vật kính ngâm dầu 100x: loại vật kính này khá mắc tiền. Sự nguy hiểm là sinh viên, học sinh thường lầm lẫn vật kính ngâm dầu với vật kính thường soi trong không khí, và làm dơ những vật kính thường khi soi dầu. Khi lam mẫu được nhỏ dầu, không thể sử dụng các vật kính có độ phóng đại thấp. Không khuyến nghị sử dụng vật kính ngâm dầu mà không kèm với dầu soi. Chất lượng hình ảnh sẽ rất thấp và học sinh, sinh viên có thể làm vật kính va chạm với lam mẫu khi cố gắng tìm tiêu cự phù hợp. Nếu dầu không được lau đúng cách, bụi sẽ bám dần dần làm giảm chất lượng hình ảnh. Vì thế chỉ lựa chọn vật kính ngâm dầu 100x nếu mục đích dạy cho sinh viên sử dụng loại vật kính này hoặc cần độ phóng đại cao như quan sát nhiễm sắc thể trong tế bào.
Quang học tương phản pha: nhìn chung là mắc tiền. Quang học này sẽ biến đổi màu sắc tự nhiên của mẫu bởi vì nó chuyển các chỉ số khúc xạ khác nhau thành các độ sáng khác nhau. Loại này rất hữu dụng để quan sát các vi khuẩn không nhuộm. Loại này không cần thiết đối với mức độ giáo dục cơ sở ở trường học.
Đèn chiếu sáng Kohler: hệ thống chiếu sáng này rất hữu dụng khi chụp ảnh từ kính hiển vi. Sinh viên có thể gặp các vấn đề với màng chắn sáng của hệ thống này. Hệ thống cần phải được căn chỉnh thích hợp trước khi sử dụng.
Vật kính tiêu sắc phức hợp: vật kính này sửa lỗi quang sai màu và thường được sử dụng trong chụp ảnh để có những hình ảnh chất lượng cao. Vì thế để sử dụng cho mục đích giáo dục, chỉ cần vật kính tiêu sắc.
Vật kính phẳng: vật kính này cho hình ảnh tập trung từ trung tâm đến ngoài rìa, thường được sử dụng trong chụp ảnh. Do vậy không cần sử dụng loại này trong giáo dục vì nó rất mắc tiền.